新疆交通厅主要职责：

（一）贯彻执行国家和自治区有关公路、水路交通行业的方针、政策、法规，拟定相关政策、法规，并组织实施和监督检查。

（二）编制自治区公路、水路交通发展规划、中长期计划并监督实施。

（三）负责管辖范围内的国道、省道、县道及重要专用公路的建设、养护、路政等组织管理。

（四）指导我区交通行业体制改革；会同有关部门培育和管理交通运输市场和交通基础设施建设市场．建立完善信息服务体系，维护全区交通行业的平等竞争秩序；引导交通运输行业优化结构，协调发展。

（五）组织交通规费用征稽；负责汽车维修市场、车辆技术检测、汽车驾驶学校、培训工作的行业管理。

（六）贯彻执行交通行业科技政策、技术标准和规范；组织重大科技开发，推动行业科技进步。

（七）负责并指导自治区交通行业财务、审计统计工作：协同和会同有关部门制定交通行业价格 税收及有关方面的经济政策。

（八）指导交通行业的猜神文明和职工队伍建设，组织指导全区交通行业成人及职业技术教育培训工作，会同有关部门管理自治区公路交通治安保卫工作。

（九）负贸交通行业的法制宣传、交通行政复议工作；负责指导利用外资、开展国际交通经济技术交流与合作工作。

（十）负责全区交通状备工作；合理和指导自治区港航监督和船舶检验工作。

（十一）承办自治区人民政府交办的其他工作。